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SSCP 技術の概略図

一本鎖高次構造多型(SSCP)解析は、微生物からヒトまで多様な生物種を対象として大量のサンプルに含まれるさまざまなゲノム変異を同定できるため、幅広く使用されているスクリーニング技術です。

SSCP 解析は、電気泳動移動度の違いを利用して配列変異(一塩基変異などの小さな変異)を検出します。 配列に変異のある DNA は、非変性(または部分変性)状態でキャピラリ電気泳動すると、変異がたとえ一塩基対でも野生型と比べて移動度に測定可能な違いが現れます。

SSCP 解析の手順

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。


推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用して、PCR で目的の領域を増幅します。

推奨製品: PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適なポリマーと電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)はどれですか?

ポリマー:

  機器
 3730xl
3730xL
3730
3730
3500xl
3500xL
3500
3500
3130xl
3130xL
3130
3130
310
310
キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
高次構造解析
- SSCPNNNNAAS

SSCP プロファイルを解析します。

お客様に最適なデータ解析ソフトウェアとは?

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。


推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用して、PCR で目的の領域を増幅します。

推奨製品: PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適なポリマーと電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)はどれですか?

ポリマー:

  機器
 3730xl
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キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
高次構造解析
- SSCPNNNNAAS

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SSCP 解析の手順

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。


推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用して、PCR で目的の領域を増幅します。

推奨製品: PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適なポリマーと電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)はどれですか?

ポリマー:

  機器
 3730xl
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キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
高次構造解析
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DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。


推奨製品: DNA単離法

PCR キット

蛍光標識プライマーを使用して、PCR で目的の領域を増幅します。

推奨製品: PCR の実行

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適なポリマーと電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)はどれですか?

ポリマー:

  機器
 3730xl
3730xL
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3500xl
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キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
高次構造解析
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SSCP 解析用の推奨製品

GeneMapper® ソフトウェア

Verti サーマル サイクラ

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For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.