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멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅은 정확하고 정량적인 결과, 안정적인 신호 및 점점 인기가 높아지고 있는 단일 블랏에서 다수의 단백질 표적을 명확하게 평가할 수 있는 기능을 제공합니다. 웨스턴 블로팅 검출을 위한 다양한 형광 염료 및 항체와 새로운 이미징 시스템을 사용할 수 있는 멀티플렉스 웨스턴 블로팅은 시간을 절약하고 비용을 절감하며 데이터 생성 및 수집의 효율성을 향상시킬 수 있습니다.
여기서 당사는 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅을 시료 전처리에서 데이터 수집까지 5 단계로 나누어 각 단계를 최적화하고 방해 요소를 피하여 최상의 결과를 얻을 수 있도록 지원합니다.
웨스턴 블로팅을 위해 사용되는 단백질 시료는 조직, 세포 및 세포구성요소 분획을 비롯한 다양한 소스에서 얻을 수 있습니다. 이러한 소스로부터 단백질을 분리하고 정제하기 위해 다양한 방법을 사용할 수 있습니다.
이는 백그라운드 형광에 기여할 수 있는 오염 물질의 유입을 방지하기 위해 형광 웨스턴 블로팅 실험에 필요한 단백질 시료를 전처리할 때 중요합니다. Bromophenol blue는 이미징 중에 백그라운드 형광에 기여합니다.
아래와 같은 총 단백질 추출 시약 및 키트는 웨스턴 블로팅과 호환되는 추출물을 제공합니다.
시료 유형 | 목표 | 권장되는 Thermo Scientific 시약 또는 키트 |
---|---|---|
일차 배양 또는 포유류 세포 또는 조직 | 총 단백질 추출 | M-PER Reagent T-PER Reagent N-PER Reagent RIPA Lysis and Extraction Buffer Pierce IP Lysis Buffer |
배양된 포유류 세포 또는 조직 | 세포구성요소 분획 또는 소기관 분리 | NE-PER Reagent Subcellular Fractionation Kits Mitochondria Isolation Kits Pierce Cell Surface Protein Isolation Kit Syn-PER Reagent Lysosomes Enrichment Kit |
세균 세포 | 총 단백질 추출 | B-PER Reagent |
효모 세포 | 총 단백질 추출 | Y-PER Reagent Y-PER Plus Reagent |
곤충 세포(바큘로바이러스) | 총 단백질 추출 | I-PER Reagent |
식물 조직(잎, 줄기, 뿌리, 꽃) | 총 단백질 추출 | P-PER Reagent |
단백질 시료의 농도를 알면 전기영동 단계 중에 젤에 로딩할 적절한 양을 결정하는 데 도움이 됩니다. 시료의 단백질 농도를 측정하는 데 다양한 단백질 어세이를 사용할 수 있습니다. 단백질 어세이 선택 가이드를 사용하여 용도에 적합한 단백질 어세이를 결정할 수 있습니다.
신뢰할 수 있는 단백질 정량 및 분석 외에도 Thermo Scientific Multiskan Sky 마이크로플레이트 분광광도계를 사용하여 DNA 및 RNA 분석 및 ELISA와 같은 UV-Vis 측광 연구 애플리케이션을 수행할 수 있습니다. Multiskan Sky 리더로 넓은 파장 범위(200-1000 nm)를 지원하고 경로 길이 보정이 가능하며 판독 속도가 빠릅니다. µDrop 플레이트 옵션으로 미량 분석이 가능합니다. 한 번에 최대 16회의 NanoDrop 측정을 수행하는 것과 같습니다. 직관적인 터치스크린 사용자 인터페이스, 온보드 소프트웨어 및 내장 프로토콜을 통해 장비에서 직접 빠른 측정을 실행할 수 있습니다. 또는 장비 구매 시 당사의 무제한 라이선스와 사용이 간편한 Thermo Scientific SkanIt 소프트웨어를 사용하여 광범위한 이미 만들어진 프로토콜 온라인 라이브러리에 액세스할 수 있습니다.
단백질 젤 전기영동을 사용하여 전처리된 단백질 시료의 분리는 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅의 두 번째 단계입니다. 단백질 젤 화학 및 폴리아크릴아미드 농도를 신중하게 선택하여 표적 단백질을 서로 효과적으로 분리할 수 있습니다. 더 선명한 밴딩 패턴을 제공하는 데 도움이 되는 폴리아크릴아미드 농도 구배를 제공하는 그래디언트 젤 사용을 고려하십시오.
단백질에 적합한 단백질 젤 화학 물질을 선택하면 표적 단백질의 최적 분해능을 얻을 수 있습니다. 당사의 사전 제작 단백질 젤은 4가지 각기 다른 화학 물질로 제공됩니다. 화학 물질 중 어떤 것을 사용할지 여부는 분리 중인 단백질의 존재량, 단백질의 크기에 따라 달라집니다.
최적의 단백질 분해능을 위해 적합한 단백질 젤 및 버퍼를 찾아보십시오.
단백질 시료 유형 | 젤 화학 | 프리캐스트 젤 | 샘플 버퍼* | 단백질 래더 | 러닝 버퍼 | 트랜스퍼 버퍼 |
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저존재비/번역후 수정됨 광범위 분자량(6–400 kDa) | Bis-Tris | Bolt Bis-Tris Plus(최대 60 μL 로딩) | Fluorescent Compatible Sample Buffer | iBright Prestained Protein Ladder | Bolt MOPS SDS Buffer (15–260 kDa); Bolt MES SDS Buffer (3.5–160 kDa); 환원된 샘플을 위해 Bolt Antioxidant 추가 | Bolt Transfer Buffer |
NuPAGE Bis-Tris | NuPAGE MOPS SDS Buffer (15–260 kDa); Bolt MES SDS Buffer (3.5–160 kDa); 환원된 샘플을 위해 Bolt Antioxidant 추가 | NuPAGE Transfer Buffer | ||||
고존재비 광범위 분자량(6–400 kDa) | Tris-glycine | Novex Tris-Glycine WedgeWell format | Novex Tris-Glycine SDS Running Buffer | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer | ||
고분자량(40–500 kDa) | Tris-acetate | NuPAGE Tris-Acetate Gels | Spectra Multicolor High Range Protein Ladder | NuPAGE Tris-Acetate SDS Running Buffer | NuPAGE Transfer Buffer | |
저분자량(2.5–40 kDa) | Tricine | Novex Tricine Mini Gels | Spectra Multicolor Low Range Protein Ladder | Novex Tricing SDS Running Buffer | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer | |
* 시료를 70°C에서 10분간 가열 |
Bromophenol blue를 함유한 샘플 버퍼는 형광을 발하여 백그라운드 증가에 기여할 수 있습니다. Bromophenol blue를 함유한 샘플 버퍼를 사용하는 경우, 백그라운드 형광 신호를 피하기 위해 염료 전면을 트랜스퍼 전에 젤로부터 제거하거나 트랜스퍼 후에 멤브레인으로부터 절단할 수 있습니다.
Invitrogen Fluorescent Compatible Sample Buffer(카탈로그 No. LC2570)과 같이 Bromophenol blue를 함유하지 않은 형광 호환 샘플 버퍼의 사용을 고려하십시오.
iBright 사전 염색 단백질 래더는 중간 범위 분자량 단백질의 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅을 위한 분자량 마커로 사용하는 것이 좋습니다. 전기영동 중에 단백질 밴드를 직접 시각화할 수 있으며 다음과 같은 특징이 있습니다.
표준 사전 염색 분자량 마커를 사용할 수 있지만 마커에 형광 밴드가 포함되어 있으면 과부하가 백그라운드 형광을 증가시키고 인접 레인으로의 신호 블리드를 증가시킬 수 있으므로 로딩량을 최적화해야 합니다. iBright 사전 염색 단백질 래더를 사용하면 젤에 로드되는 분자량 마커의 양을 줄일 수 있습니다. 일반적으로 시각화 및 형광 검출에는 2-4 μL이면 충분합니다.
단백질 젤 웰컴 팩은 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅 실험에서 Invitrogen 프리캐스트 단백질 젤 사용을 시작하기 위한 경제적인 방법입니다. 단백질 젤 웰컴 팩은 단백질 젤 화학 물질 각각에 사용할 수 있으며 프리캐스트 단백질 미니 또는 미디 젤, 버퍼, 래더, 미니 젤 탱크 또는 SureLock 탠덤 미디 젤 탱크와 함께 제공되므로 개별 부품 비용을 크게 절감할 수 있습니다. iBright 사전 염색 단백질 래더 및 Invitrogen 형광 호환 샘플 버퍼(카탈로그 번호 LC2570)은 단백질 젤 웰컴 팩에 포함되지 않으며 별도로 주문해야 합니다.
전기영동 후 폴리아크릴아미드 젤에서 니트로셀룰로오스 또는 폴리비닐리덴 디플루오라이드(PVDF) 멤브레인으로 단백질을 효율적으로 트랜스퍼하는 것은 면역검출 기법을 사용하여 특정 단백질을 검출하기 위한 웨스턴 블로팅에서 중요한 단계입니다.
젤 트랜스퍼 전기영동 방법은 습식 트랜스퍼, 세미-드라이 트랜스퍼 및 드라이 트랜스퍼로 분류할 수 있습니다.
아래 선택 표를 사용하여 트랜스퍼 방법과 필요한 장비, 버퍼 및 시간 요구 사항을 비교해 보십시오.
습식 트랜스퍼 | 세미-드라이 트랜스퍼 | 드라이 트랜스퍼 | |||
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XCell II Blot Module | SureLock Tandem Midi Blot Module | Power Blotter Systems | iBlot 3 Western Blot Transfer System | ||
용량 | 블랏 모듈당 미니 젤 1개, 탱크당 블랏 모듈 1–2개 | 최대 2개의 미니 블랏 | 블랏 모듈당 미디 젤 1개, 탱크당 블랏 모듈 1–2개 | 미니 젤 1–4개 또는 미디 젤 1–2개 | 미디 젤 1-2개 또는 미니 젤 1-4개 |
트랜스퍼 시간 | 60분 | 60–120분 | 30분 | 7–10분 | 3분 미만 |
블로팅 영역(cm) | 9 x 9 | 9 x 9 | 9.2 x 14.4 | 10 x 18 또는 21 x 22.5 | 8.5 x 13.5 |
트랜스퍼 버퍼 볼륨 | 블랏 모듈당 220 mL | 200 mL | 블롯 모듈당 300 mL | 사전 절단 멤브레인 & 필터: 50–100 mL, Select 트랜스퍼 스택: 버퍼 불필요 | 버퍼 불필요 |
전원 공급 | 외부 | 외부 | 외부 | 내부 | 내부 |
필요한 장비 | Mini Gel Tank: 최대 2개의 미니 블랏 모듈을 수용할 수 있는 용량 | XCell SureLock Mini-Cell | SureLock Tandem Midi Gel Tank | — | — |
자세히 알아보기 | 자세히 알아보기 | 자세히 알아보기 | 자세히 알아보기 | 자세히 알아보기 |
동영상: iBlot 3 웨스턴 블로팅 트랜스퍼 시스템으로 단백질 젤 트랜스퍼를 수행하는 것이 얼마나 쉬운지 확인하십시오.
백그라운드 형광의 주요 소스를 제거하려면 니트로셀룰로오스를 비롯한 자가형광 특성이 낮은 멤브레인과 Thermo Scientific 니트로셀룰로오스 멤브레인(카탈로그 번호 88018) 및 저형광 PVDF 트랜스퍼 멤브레인(카탈로그 번호 22860)과 같은 특수 저형광 PVDF 멤브레인을 사용하십시오. 백그라운드 형광 및 아티팩트에 영향을 줄 수 있는 멤브레인의 오염 및 스크래치를 제한하기 위해 장갑을 낀 손과 깨끗한 무딘 핀셋으로만 멤브레인을 다루십시오.
도움말: 멤브레인에 펜을 사용하지 마십시오. 많은 잉크가 형광을 발합니다. 대신 연필을 사용하십시오.
아래 표를 사용하여 사용 중인 단백질 젤에 맞는 올바른 트랜스퍼 버퍼를 확인하십시오.
단백질 시료 유형 | 젤 화학 | 프리캐스트 젤 | 트랜스퍼 버퍼 |
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저존재비/번역 후 수정됨 광범위 분자량(6–400 kDa) | Bis-Tris | Bolt Bis-Tris Plus(최대 60 μL 로딩) | Bolt Transfer Buffer |
NuPAGE Bis-Tris | NuPAGE Transfer Buffer | ||
고존재비 광범위 분자량(6–400 kDa) | Tris-glycine | Novex Tris-Glycine WedgeWell 형식 | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer |
고분자량(40–500 kDa) | Tris-acetate | NuPAGE Tris-Acetate Gels | NuPAGE Transfer Buffer |
저분자량(2.5–40 kDa) | Tricine | Novex Tricine Mini Gels | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer |
성공적인 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅을 위해서는 항체 및 형광 라벨의 신중한 선택이 필요합니다. 애플리케이션 노트 다운로드: 항체 및 형광 라벨 선택에 대한 광범위한 논의를 위한 형광 웨스턴 블로팅 - 멀티플렉스를 위한 가이드
광학적으로 뚜렷한 스펙트럼을 가진 형광단을 선택하여 교차 채널 형광을 방지하십시오. 뚜렷한 여기(excitation) 스펙트럼 및 방출(emission) 스펙트럼을 위한 멀티플렉스 실험을 위해 선택된 형광단의 예는 아래 그림 1과 2에 나와 있습니다. 1 ~ 4프로브 멀티플렉스 웨스턴 실험에서 iBright FL1500 이미징 시스템과 함께 사용할 수 있는 멀티플렉스 형광단 조합의 예는 표 1을 참조하십시오.
표 1. iBright FL 이미징 시스템을 사용한 성공적인 멀티플렉스 분석을 위한 형광단 조합의 예.
타겟 개수 | 콘주게이트 1 | 콘주게이트 2 | 콘주게이트 3 | 콘주게이트 4 |
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1 | Alexa Fluor Plus 647 | |||
2 | Alexa Fluor Plus 647 | Alexa Fluor 546 | ||
3 | Alexa Fluor Plus 647 | Alexa Fluor 546 | Alexa Fluor Plus 488 | |
4 | Alexa Fluor Plus 647 | Alexa Fluor 546 | Alexa Fluor Plus 488 | Alexa Fluor Plus 800 |
그림 1. 특별히 선택된 여기(excitation) 스펙트럼이 뚜렷한 형광단을 사용한 멀티플렉스 실험의 예. Fluorescence SpectraViewer에서 생성된 이 예에서 Alexa Fluor Plus 488 및 Alexa Fluor 546 형광단의 여기(excitation) 스펙트럼(파선)은 여기 필터 범위 내에서 최소한의 중첩을 갖습니다. 두 형광단이 방출 필터 범위 내에 방출(emission) 스펙트럼(실선)의 일부를 갖지만 Alexa Fluor 546은 Alexa Fluor Plus 488에 대해 선택된 여기(excitation) 필터에 의해 여기되지 않기 때문에 방출 필터를 통과하기 위해 존재하는 Alexa Fluor 546의 형광은 없습니다.
그림 2. 특별히 선택된 방출(emission) 스펙트럼이 뚜렷한 형광단을 사용한 멀티플렉스 실험의 예. Fluorescence SpectraViewer에서 생성된 이 예에서 Alexa Fluor Plus 680 및 Alexa Fluor 790의 방출(emission) 스펙트럼(실선)은 두 개의 방출 필터 범위 내에서 중첩되지 않습니다. 두 형광단 모두 여기 필터 1 범위 내에서 여기 스펙트럼(파선)의 일부를 가지고 있음에도 불구하고 해당 여기 범위에서 생성된 Alexa Fluor 790 형광은 방출 필터 1을 통과할 수 있는 파장 내에 있지 않으므로 Alexa Fluor 790의 형광이 해당 채널의 카메라 검출기에 도달할 수 없습니다.
형광 웨스턴 블로팅으로 희귀하거나 귀중한 시료에서 미량의 표적을 검출하고 시각화해야 합니까?
아래 검색 도구를 사용하여 관심 있는 항체를 찾아 보십시오. 그런 다음, 표적 또는 숙주 종, 단클론 또는 다클론 항체 유형, 애플리케이션 및 기타 조건으로 결과를 필터링할 수 있습니다.
Invitrogen iBind 및 iBind Flex Western 장치를 사용하여 모든 블로킹, 항체 인큐베이션 및 세척 단계를 자동화할 수 있습니다. thermofisher.com/ibind에서 자세히 알아보십시오.
문제 | 가능한 원인 | 솔루션 |
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신호가 약하거나 없음 | 1차 항체 양이 부족함 |
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항체 활성 손실 |
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이미징 노출 시간이 너무 짧음 |
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잘못된 장비 설정 |
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계면활성제 사용 |
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블로킹 버퍼가 항원 차단 |
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젤에 로드된 시료 양 부족 |
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단백질 트랜스퍼 불량 또는 트랜스퍼 후 단백질 손실 |
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비특이적 밴드 | 관심 표적의 낮은 항체 특이성 |
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시료 무결성 불량 |
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멀티플렉스 검출에서 항체 교차 반응 |
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멀티플렉스 분석 시 다른 채널의 형광 유출(bleed-through) 발생(예기치 않은 밴드 모양) |
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백그라운드 문제(높음, 고르지 않음 또는 반점) | 멤브레인 오염으로 인한 높은 백그라운드 |
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단백질 마커 또는 래더 오버로딩으로 인한 아티팩트 |
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최적 상태가 아닌 세척액 또는 희석액 |
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과다 2차 항체로 인한 높은 백그라운드 |
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멤브레인 건조로 인해 얼룩지거나 고르지 않은 백그라운드 |
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잘못된 멤브레인 선택 |
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멤브레인에 묻은 먼지와 지문 |
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최근 이미징 소프트웨어 및 장비 감도의 발전으로 이제 형광 이미지 캡처 및 정량적 웨스턴 블로팅 분석이 더욱 쉬워졌습니다. 사용하려는 장비가 감지하려는 형광단의 수를 캡처할 수 있는지, 이미저에 형광단과 함께 사용할 올바른 필터가 있는지 여부를 확인하십시오.
iBright FL1500 이미징 시스템은 높은 감도와 효율성을 제공하며 다중 모드 이미지 캡처 기능을 갖춘 강력하고 편리한 시스템입니다(아래 이미지 2 참조). iBright FL1500은 4-plex 이미지를 쉽게 캡처할 수 있습니다. 대형 정전식 터치스크린 인터페이스와 지능적으로 설계된 소프트웨어가 특징입니다.
iBright FL1500 이미징 시스템에 대한 제품 세부 정보 보기
iBright FL1500 이미징 시스템 브로셔 다운로드
단백질 정규화는 신뢰할 수 있고 재현 가능한 정량적 웨스턴 블로팅 결과를 얻기 위한 중요한 단계이며 하우스키핑 단백질 또는 총 단백질 정규화를 사용하여 수행할 수 있습니다. 이상적인 조건에서는 정규화가 필요하지 않지만 시료 로딩 및 트랜스퍼 효율 등의 요인으로 인해 웨스턴 블랏 정규화가 필수적입니다. 하우스키핑 단백질은 실험 조건에 의해 영향을 받을 수 있으므로 총 단백질 정규화가 보다 신뢰할 수 있는 방법입니다. 웨스턴 블로팅 데이터의 총 단백질 정규화에서 Invitrogen 무염색 단백질 라벨링 시약은 트랜스퍼 후 멤브레인에 적용되는 빠르고 사용하기 쉬운 시약이며 민감한 선형 검출 성능을 제공합니다.
iBright FL1500 이미징 시스템에는 무염색 단백질 라벨링 시약 및 기타 다양한 방법을 사용하여 정규화를 쉽게 수행할 수 있는 소프트웨어가 포함되어 있습니다.
내부 로딩 제거 기능을 사용하여 정규화의 기본 원칙을 제공하고 웨스턴 블로팅을 정확하게 정규화하여 의미 있고 재현 가능한 데이터를 얻는 방법을 설명하는 이 기술 노트를 다운로드하십시오.
다른 항체로 블롯을 재프로빙하려면 Restore Fluorescent 웨스턴 블로팅 스트리핑 버퍼를 사용하십시오. Restore Fluorescent 웨스턴 블로팅 스트리핑 버퍼는 PVDF 멤브레인을 재사용 가능하게 하여 웨스턴 블로팅 최적화 프로세스를 간소화하고 다른 1차 항체로 동일한 블랏을 재프로빙하여 대체 표적을 검출할 수 있도록 합니다. Restore Fluorescent 웨스턴 블로팅 스트리핑 버퍼는 저형광 PVDF 멤브레인에만 사용됩니다.
전 과정에서 사용할 웨스턴 블로팅 솔루션이 필요하십니까?
아니면 주요 블로팅 단계 중 하나의 성능을 향상시키고 싶으십니까?
웨스턴 블로팅을 위해 사용되는 단백질 시료는 조직, 세포 및 세포구성요소 분획을 비롯한 다양한 소스에서 얻을 수 있습니다. 이러한 소스로부터 단백질을 분리하고 정제하기 위해 다양한 방법을 사용할 수 있습니다.
이는 백그라운드 형광에 기여할 수 있는 오염 물질의 유입을 방지하기 위해 형광 웨스턴 블로팅 실험에 필요한 단백질 시료를 전처리할 때 중요합니다. Bromophenol blue는 이미징 중에 백그라운드 형광에 기여합니다.
아래와 같은 총 단백질 추출 시약 및 키트는 웨스턴 블로팅과 호환되는 추출물을 제공합니다.
시료 유형 | 목표 | 권장되는 Thermo Scientific 시약 또는 키트 |
---|---|---|
일차 배양 또는 포유류 세포 또는 조직 | 총 단백질 추출 | M-PER Reagent T-PER Reagent N-PER Reagent RIPA Lysis and Extraction Buffer Pierce IP Lysis Buffer |
배양된 포유류 세포 또는 조직 | 세포구성요소 분획 또는 소기관 분리 | NE-PER Reagent Subcellular Fractionation Kits Mitochondria Isolation Kits Pierce Cell Surface Protein Isolation Kit Syn-PER Reagent Lysosomes Enrichment Kit |
세균 세포 | 총 단백질 추출 | B-PER Reagent |
효모 세포 | 총 단백질 추출 | Y-PER Reagent Y-PER Plus Reagent |
곤충 세포(바큘로바이러스) | 총 단백질 추출 | I-PER Reagent |
식물 조직(잎, 줄기, 뿌리, 꽃) | 총 단백질 추출 | P-PER Reagent |
단백질 시료의 농도를 알면 전기영동 단계 중에 젤에 로딩할 적절한 양을 결정하는 데 도움이 됩니다. 시료의 단백질 농도를 측정하는 데 다양한 단백질 어세이를 사용할 수 있습니다. 단백질 어세이 선택 가이드를 사용하여 용도에 적합한 단백질 어세이를 결정할 수 있습니다.
신뢰할 수 있는 단백질 정량 및 분석 외에도 Thermo Scientific Multiskan Sky 마이크로플레이트 분광광도계를 사용하여 DNA 및 RNA 분석 및 ELISA와 같은 UV-Vis 측광 연구 애플리케이션을 수행할 수 있습니다. Multiskan Sky 리더로 넓은 파장 범위(200-1000 nm)를 지원하고 경로 길이 보정이 가능하며 판독 속도가 빠릅니다. µDrop 플레이트 옵션으로 미량 분석이 가능합니다. 한 번에 최대 16회의 NanoDrop 측정을 수행하는 것과 같습니다. 직관적인 터치스크린 사용자 인터페이스, 온보드 소프트웨어 및 내장 프로토콜을 통해 장비에서 직접 빠른 측정을 실행할 수 있습니다. 또는 장비 구매 시 당사의 무제한 라이선스와 사용이 간편한 Thermo Scientific SkanIt 소프트웨어를 사용하여 광범위한 이미 만들어진 프로토콜 온라인 라이브러리에 액세스할 수 있습니다.
단백질 젤 전기영동을 사용하여 전처리된 단백질 시료의 분리는 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅의 두 번째 단계입니다. 단백질 젤 화학 및 폴리아크릴아미드 농도를 신중하게 선택하여 표적 단백질을 서로 효과적으로 분리할 수 있습니다. 더 선명한 밴딩 패턴을 제공하는 데 도움이 되는 폴리아크릴아미드 농도 구배를 제공하는 그래디언트 젤 사용을 고려하십시오.
단백질에 적합한 단백질 젤 화학 물질을 선택하면 표적 단백질의 최적 분해능을 얻을 수 있습니다. 당사의 사전 제작 단백질 젤은 4가지 각기 다른 화학 물질로 제공됩니다. 화학 물질 중 어떤 것을 사용할지 여부는 분리 중인 단백질의 존재량, 단백질의 크기에 따라 달라집니다.
최적의 단백질 분해능을 위해 적합한 단백질 젤 및 버퍼를 찾아보십시오.
단백질 시료 유형 | 젤 화학 | 프리캐스트 젤 | 샘플 버퍼* | 단백질 래더 | 러닝 버퍼 | 트랜스퍼 버퍼 |
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저존재비/번역후 수정됨 광범위 분자량(6–400 kDa) | Bis-Tris | Bolt Bis-Tris Plus(최대 60 μL 로딩) | Fluorescent Compatible Sample Buffer | iBright Prestained Protein Ladder | Bolt MOPS SDS Buffer (15–260 kDa); Bolt MES SDS Buffer (3.5–160 kDa); 환원된 샘플을 위해 Bolt Antioxidant 추가 | Bolt Transfer Buffer |
NuPAGE Bis-Tris | NuPAGE MOPS SDS Buffer (15–260 kDa); Bolt MES SDS Buffer (3.5–160 kDa); 환원된 샘플을 위해 Bolt Antioxidant 추가 | NuPAGE Transfer Buffer | ||||
고존재비 광범위 분자량(6–400 kDa) | Tris-glycine | Novex Tris-Glycine WedgeWell format | Novex Tris-Glycine SDS Running Buffer | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer | ||
고분자량(40–500 kDa) | Tris-acetate | NuPAGE Tris-Acetate Gels | Spectra Multicolor High Range Protein Ladder | NuPAGE Tris-Acetate SDS Running Buffer | NuPAGE Transfer Buffer | |
저분자량(2.5–40 kDa) | Tricine | Novex Tricine Mini Gels | Spectra Multicolor Low Range Protein Ladder | Novex Tricing SDS Running Buffer | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer | |
* 시료를 70°C에서 10분간 가열 |
Bromophenol blue를 함유한 샘플 버퍼는 형광을 발하여 백그라운드 증가에 기여할 수 있습니다. Bromophenol blue를 함유한 샘플 버퍼를 사용하는 경우, 백그라운드 형광 신호를 피하기 위해 염료 전면을 트랜스퍼 전에 젤로부터 제거하거나 트랜스퍼 후에 멤브레인으로부터 절단할 수 있습니다.
Invitrogen Fluorescent Compatible Sample Buffer(카탈로그 No. LC2570)과 같이 Bromophenol blue를 함유하지 않은 형광 호환 샘플 버퍼의 사용을 고려하십시오.
iBright 사전 염색 단백질 래더는 중간 범위 분자량 단백질의 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅을 위한 분자량 마커로 사용하는 것이 좋습니다. 전기영동 중에 단백질 밴드를 직접 시각화할 수 있으며 다음과 같은 특징이 있습니다.
표준 사전 염색 분자량 마커를 사용할 수 있지만 마커에 형광 밴드가 포함되어 있으면 과부하가 백그라운드 형광을 증가시키고 인접 레인으로의 신호 블리드를 증가시킬 수 있으므로 로딩량을 최적화해야 합니다. iBright 사전 염색 단백질 래더를 사용하면 젤에 로드되는 분자량 마커의 양을 줄일 수 있습니다. 일반적으로 시각화 및 형광 검출에는 2-4 μL이면 충분합니다.
단백질 젤 웰컴 팩은 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅 실험에서 Invitrogen 프리캐스트 단백질 젤 사용을 시작하기 위한 경제적인 방법입니다. 단백질 젤 웰컴 팩은 단백질 젤 화학 물질 각각에 사용할 수 있으며 프리캐스트 단백질 미니 또는 미디 젤, 버퍼, 래더, 미니 젤 탱크 또는 SureLock 탠덤 미디 젤 탱크와 함께 제공되므로 개별 부품 비용을 크게 절감할 수 있습니다. iBright 사전 염색 단백질 래더 및 Invitrogen 형광 호환 샘플 버퍼(카탈로그 번호 LC2570)은 단백질 젤 웰컴 팩에 포함되지 않으며 별도로 주문해야 합니다.
전기영동 후 폴리아크릴아미드 젤에서 니트로셀룰로오스 또는 폴리비닐리덴 디플루오라이드(PVDF) 멤브레인으로 단백질을 효율적으로 트랜스퍼하는 것은 면역검출 기법을 사용하여 특정 단백질을 검출하기 위한 웨스턴 블로팅에서 중요한 단계입니다.
젤 트랜스퍼 전기영동 방법은 습식 트랜스퍼, 세미-드라이 트랜스퍼 및 드라이 트랜스퍼로 분류할 수 있습니다.
아래 선택 표를 사용하여 트랜스퍼 방법과 필요한 장비, 버퍼 및 시간 요구 사항을 비교해 보십시오.
습식 트랜스퍼 | 세미-드라이 트랜스퍼 | 드라이 트랜스퍼 | |||
---|---|---|---|---|---|
XCell II Blot Module | SureLock Tandem Midi Blot Module | Power Blotter Systems | iBlot 3 Western Blot Transfer System | ||
용량 | 블랏 모듈당 미니 젤 1개, 탱크당 블랏 모듈 1–2개 | 최대 2개의 미니 블랏 | 블랏 모듈당 미디 젤 1개, 탱크당 블랏 모듈 1–2개 | 미니 젤 1–4개 또는 미디 젤 1–2개 | 미디 젤 1-2개 또는 미니 젤 1-4개 |
트랜스퍼 시간 | 60분 | 60–120분 | 30분 | 7–10분 | 3분 미만 |
블로팅 영역(cm) | 9 x 9 | 9 x 9 | 9.2 x 14.4 | 10 x 18 또는 21 x 22.5 | 8.5 x 13.5 |
트랜스퍼 버퍼 볼륨 | 블랏 모듈당 220 mL | 200 mL | 블롯 모듈당 300 mL | 사전 절단 멤브레인 & 필터: 50–100 mL, Select 트랜스퍼 스택: 버퍼 불필요 | 버퍼 불필요 |
전원 공급 | 외부 | 외부 | 외부 | 내부 | 내부 |
필요한 장비 | Mini Gel Tank: 최대 2개의 미니 블랏 모듈을 수용할 수 있는 용량 | XCell SureLock Mini-Cell | SureLock Tandem Midi Gel Tank | — | — |
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동영상: iBlot 3 웨스턴 블로팅 트랜스퍼 시스템으로 단백질 젤 트랜스퍼를 수행하는 것이 얼마나 쉬운지 확인하십시오.
백그라운드 형광의 주요 소스를 제거하려면 니트로셀룰로오스를 비롯한 자가형광 특성이 낮은 멤브레인과 Thermo Scientific 니트로셀룰로오스 멤브레인(카탈로그 번호 88018) 및 저형광 PVDF 트랜스퍼 멤브레인(카탈로그 번호 22860)과 같은 특수 저형광 PVDF 멤브레인을 사용하십시오. 백그라운드 형광 및 아티팩트에 영향을 줄 수 있는 멤브레인의 오염 및 스크래치를 제한하기 위해 장갑을 낀 손과 깨끗한 무딘 핀셋으로만 멤브레인을 다루십시오.
도움말: 멤브레인에 펜을 사용하지 마십시오. 많은 잉크가 형광을 발합니다. 대신 연필을 사용하십시오.
아래 표를 사용하여 사용 중인 단백질 젤에 맞는 올바른 트랜스퍼 버퍼를 확인하십시오.
단백질 시료 유형 | 젤 화학 | 프리캐스트 젤 | 트랜스퍼 버퍼 |
---|---|---|---|
저존재비/번역 후 수정됨 광범위 분자량(6–400 kDa) | Bis-Tris | Bolt Bis-Tris Plus(최대 60 μL 로딩) | Bolt Transfer Buffer |
NuPAGE Bis-Tris | NuPAGE Transfer Buffer | ||
고존재비 광범위 분자량(6–400 kDa) | Tris-glycine | Novex Tris-Glycine WedgeWell 형식 | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer |
고분자량(40–500 kDa) | Tris-acetate | NuPAGE Tris-Acetate Gels | NuPAGE Transfer Buffer |
저분자량(2.5–40 kDa) | Tricine | Novex Tricine Mini Gels | Novex Tris-Glycine Transfer Buffer |
성공적인 멀티플렉스 형광 웨스턴 블로팅을 위해서는 항체 및 형광 라벨의 신중한 선택이 필요합니다. 애플리케이션 노트 다운로드: 항체 및 형광 라벨 선택에 대한 광범위한 논의를 위한 형광 웨스턴 블로팅 - 멀티플렉스를 위한 가이드
광학적으로 뚜렷한 스펙트럼을 가진 형광단을 선택하여 교차 채널 형광을 방지하십시오. 뚜렷한 여기(excitation) 스펙트럼 및 방출(emission) 스펙트럼을 위한 멀티플렉스 실험을 위해 선택된 형광단의 예는 아래 그림 1과 2에 나와 있습니다. 1 ~ 4프로브 멀티플렉스 웨스턴 실험에서 iBright FL1500 이미징 시스템과 함께 사용할 수 있는 멀티플렉스 형광단 조합의 예는 표 1을 참조하십시오.
표 1. iBright FL 이미징 시스템을 사용한 성공적인 멀티플렉스 분석을 위한 형광단 조합의 예.
타겟 개수 | 콘주게이트 1 | 콘주게이트 2 | 콘주게이트 3 | 콘주게이트 4 |
---|---|---|---|---|
1 | Alexa Fluor Plus 647 | |||
2 | Alexa Fluor Plus 647 | Alexa Fluor 546 | ||
3 | Alexa Fluor Plus 647 | Alexa Fluor 546 | Alexa Fluor Plus 488 | |
4 | Alexa Fluor Plus 647 | Alexa Fluor 546 | Alexa Fluor Plus 488 | Alexa Fluor Plus 800 |
그림 1. 특별히 선택된 여기(excitation) 스펙트럼이 뚜렷한 형광단을 사용한 멀티플렉스 실험의 예. Fluorescence SpectraViewer에서 생성된 이 예에서 Alexa Fluor Plus 488 및 Alexa Fluor 546 형광단의 여기(excitation) 스펙트럼(파선)은 여기 필터 범위 내에서 최소한의 중첩을 갖습니다. 두 형광단이 방출 필터 범위 내에 방출(emission) 스펙트럼(실선)의 일부를 갖지만 Alexa Fluor 546은 Alexa Fluor Plus 488에 대해 선택된 여기(excitation) 필터에 의해 여기되지 않기 때문에 방출 필터를 통과하기 위해 존재하는 Alexa Fluor 546의 형광은 없습니다.
그림 2. 특별히 선택된 방출(emission) 스펙트럼이 뚜렷한 형광단을 사용한 멀티플렉스 실험의 예. Fluorescence SpectraViewer에서 생성된 이 예에서 Alexa Fluor Plus 680 및 Alexa Fluor 790의 방출(emission) 스펙트럼(실선)은 두 개의 방출 필터 범위 내에서 중첩되지 않습니다. 두 형광단 모두 여기 필터 1 범위 내에서 여기 스펙트럼(파선)의 일부를 가지고 있음에도 불구하고 해당 여기 범위에서 생성된 Alexa Fluor 790 형광은 방출 필터 1을 통과할 수 있는 파장 내에 있지 않으므로 Alexa Fluor 790의 형광이 해당 채널의 카메라 검출기에 도달할 수 없습니다.
형광 웨스턴 블로팅으로 희귀하거나 귀중한 시료에서 미량의 표적을 검출하고 시각화해야 합니까?
아래 검색 도구를 사용하여 관심 있는 항체를 찾아 보십시오. 그런 다음, 표적 또는 숙주 종, 단클론 또는 다클론 항체 유형, 애플리케이션 및 기타 조건으로 결과를 필터링할 수 있습니다.
Invitrogen iBind 및 iBind Flex Western 장치를 사용하여 모든 블로킹, 항체 인큐베이션 및 세척 단계를 자동화할 수 있습니다. thermofisher.com/ibind에서 자세히 알아보십시오.
문제 | 가능한 원인 | 솔루션 |
---|---|---|
신호가 약하거나 없음 | 1차 항체 양이 부족함 |
|
항체 활성 손실 |
| |
이미징 노출 시간이 너무 짧음 |
| |
잘못된 장비 설정 |
| |
계면활성제 사용 |
| |
블로킹 버퍼가 항원 차단 |
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젤에 로드된 시료 양 부족 |
| |
단백질 트랜스퍼 불량 또는 트랜스퍼 후 단백질 손실 |
| |
비특이적 밴드 | 관심 표적의 낮은 항체 특이성 |
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시료 무결성 불량 |
| |
멀티플렉스 검출에서 항체 교차 반응 |
| |
멀티플렉스 분석 시 다른 채널의 형광 유출(bleed-through) 발생(예기치 않은 밴드 모양) |
| |
백그라운드 문제(높음, 고르지 않음 또는 반점) | 멤브레인 오염으로 인한 높은 백그라운드 |
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단백질 마커 또는 래더 오버로딩으로 인한 아티팩트 |
| |
최적 상태가 아닌 세척액 또는 희석액 |
| |
과다 2차 항체로 인한 높은 백그라운드 |
| |
멤브레인 건조로 인해 얼룩지거나 고르지 않은 백그라운드 |
| |
잘못된 멤브레인 선택 |
| |
멤브레인에 묻은 먼지와 지문 |
|
최근 이미징 소프트웨어 및 장비 감도의 발전으로 이제 형광 이미지 캡처 및 정량적 웨스턴 블로팅 분석이 더욱 쉬워졌습니다. 사용하려는 장비가 감지하려는 형광단의 수를 캡처할 수 있는지, 이미저에 형광단과 함께 사용할 올바른 필터가 있는지 여부를 확인하십시오.
iBright FL1500 이미징 시스템은 높은 감도와 효율성을 제공하며 다중 모드 이미지 캡처 기능을 갖춘 강력하고 편리한 시스템입니다(아래 이미지 2 참조). iBright FL1500은 4-plex 이미지를 쉽게 캡처할 수 있습니다. 대형 정전식 터치스크린 인터페이스와 지능적으로 설계된 소프트웨어가 특징입니다.
iBright FL1500 이미징 시스템에 대한 제품 세부 정보 보기
iBright FL1500 이미징 시스템 브로셔 다운로드
단백질 정규화는 신뢰할 수 있고 재현 가능한 정량적 웨스턴 블로팅 결과를 얻기 위한 중요한 단계이며 하우스키핑 단백질 또는 총 단백질 정규화를 사용하여 수행할 수 있습니다. 이상적인 조건에서는 정규화가 필요하지 않지만 시료 로딩 및 트랜스퍼 효율 등의 요인으로 인해 웨스턴 블랏 정규화가 필수적입니다. 하우스키핑 단백질은 실험 조건에 의해 영향을 받을 수 있으므로 총 단백질 정규화가 보다 신뢰할 수 있는 방법입니다. 웨스턴 블로팅 데이터의 총 단백질 정규화에서 Invitrogen 무염색 단백질 라벨링 시약은 트랜스퍼 후 멤브레인에 적용되는 빠르고 사용하기 쉬운 시약이며 민감한 선형 검출 성능을 제공합니다.
iBright FL1500 이미징 시스템에는 무염색 단백질 라벨링 시약 및 기타 다양한 방법을 사용하여 정규화를 쉽게 수행할 수 있는 소프트웨어가 포함되어 있습니다.
내부 로딩 제거 기능을 사용하여 정규화의 기본 원칙을 제공하고 웨스턴 블로팅을 정확하게 정규화하여 의미 있고 재현 가능한 데이터를 얻는 방법을 설명하는 이 기술 노트를 다운로드하십시오.
다른 항체로 블롯을 재프로빙하려면 Restore Fluorescent 웨스턴 블로팅 스트리핑 버퍼를 사용하십시오. Restore Fluorescent 웨스턴 블로팅 스트리핑 버퍼는 PVDF 멤브레인을 재사용 가능하게 하여 웨스턴 블로팅 최적화 프로세스를 간소화하고 다른 1차 항체로 동일한 블랏을 재프로빙하여 대체 표적을 검출할 수 있도록 합니다. Restore Fluorescent 웨스턴 블로팅 스트리핑 버퍼는 저형광 PVDF 멤브레인에만 사용됩니다.
전 과정에서 사용할 웨스턴 블로팅 솔루션이 필요하십니까?
아니면 주요 블로팅 단계 중 하나의 성능을 향상시키고 싶으십니까?
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.