Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒

Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒设计可全面覆盖与免疫应答生物标志物研究相关的关键基因的相关靶标，其性能优越，可从取自 FFPE 研究样本的少至 10 ng 的输入 RNA 检测低表达基因。

该检测试剂盒可提供：

• 高度精选的内容—评估肿瘤微环境并识别药物反应的预测标志物
• 高灵敏度—同类型产品中，其对低表达基因的检测灵敏度更高
• 出色的重现性—具有清晰信噪比的广泛动态范围，增加了对优化分析软件检出结果的置信度
• 样本输入量极少—采用经验证的 Ion AmpliSeq™ 技术，仅需少至 10 ng 总 RNA 起始量，可节省珍贵的 FFPE 样本
• 自动化—借助 Ion S5™ 系统测序，在 Ion Chef™ 系统上采用 NGS 工作流程可以快速实现周转

图 1.Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒适用于生物标志物分析应用。通过该检测试剂盒的分析可助力在将来开展单独的临床试验检测和伴随诊断开发工作。

Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒为未来的临床试验研究组提供专门设计的内容。

• 同时检测 395 种与多种癌症类型免疫应答研究相关的基因
• 对低表达信号传导分子（如白介素和珈玛干扰素 [IFNG]）的检测具有高灵敏度
• 由 Oncomine™ 知识库、当前研究出版物以及全球制药和研究组织的专家提供内容支持

表 1.Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒内容含 36 个功能注释团中的 395 个基因，其中包括与淋巴细胞调控、细胞因子信号转导、淋巴细胞标志物、检查点信号通路和肿瘤表征相关的基因。 

Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒含关键临床癌症研究靶标，其中包括细胞因子信号传导基因（如 IFNG）、药物靶基因（如 CTLA4）以及 PD-1 信号转导基因（如 MTOR 和 PTEN）。

索取完整的基因列表

免疫治疗研究的靶向 NGS 方法可以提升对低表达基因的检测能力

图 2.10 份泛癌研究样本的表达范围。当研究关键免疫应答研究基因亚群（包括与 T 细胞受体信号传导和检查点信号通路相关的低表达基因）时，Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒表现出比竞争产品 N 检测试剂盒更好的检测性能。

目前，PD-1 和 PD-L1 检测可能遗漏能够表明免疫反应的重要基因。另外，IHC 的通量和再现性挑战使得研究很难保持稳定。Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒可应对这些挑战。

该试剂盒是综合解决方案（包括使用 Ion Chef 系统和 Ion S5 系统的自动化流程）的一部分，其包含文库构建试剂，以及用于从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本制备的扩增子文库执行多重 PCR 的单个引物库。根据您的通量需求，每次运行可处理 4、8 或 32 份样本，该工作流程可以灵活地运行小规模或大规模回顾性或预测性图谱分析研究样本。

图 3.当前的 IHC 免疫治疗研究缺乏重现性，并且不能从每份肿瘤样本中完成超过 1-2 种检测（左）。Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒可提供有关肿瘤微环境组成的发现，从而可以改善样本分层（右）。

图 4.可能有助于改善样本分层的初步指标。与商用试剂盒”产品 N “相比，Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒可实现更好的样本分层，当每个检测板共享的所有基因聚类时，可明显区分癌症类型。

Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒受 Ion S5 和 Ion PGM™ 测序仪支持，可让您的实验室高效运行小规模和大规模研究样本。

优化的信息学和可视化软件能极大限度降低数据分析的复杂性。分析工作流程包括数据探索组件（由免疫应答 Torrent Suite™ 插件自动运行）以及双基团差分分析（由 Affymetrix™ 转录组分析控制台 [TAC] 提供）。这些工具的结合简化了常见基因表达分析流程并提供了可输出数据文件，这些文件可采用其他第三方软件进一步探索。

这些工具可实现：

• 通过质控指标和管家基因的表达使数据合格
• 通过用户定义的基因组或检测板上的所有基因，进行样本的分层聚类
• 利用 PCA、热图以及基因表达分布图实现可视化
• 使用丰度关联图进行样本关联
• 以易于使用的表格式数据格式 (TAC) 估计倍数变化
• 采用火山图差异化显示基因 (TAC)

图 5.Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒包含文库构建试剂、文库制备引物以及结果解读分析软件。*两天的工作流程需要过夜模板准备。