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Oncomine Precision Assay
新一代肿瘤学解决方案
在 Ion Torrent Genus 系统上使用的 Oncomine Precision Assay是新一代基因组分析解决方案，让每个实验室可以通过一天的无手动操作工作流程实现基因组分析。†
在 Ion Torrent Genus 系统上使用的 Oncomine Precision Assay是新一代基因组分析解决方案，适用于各种规模的实验室。现在，实验室可以使用无手动操作工作流程来检测 EGFR、ALK、BRAF、ROS1、NTRK、RET 或 ERBB2 等关键生物标志物，一天内即可从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织或液体活检样本获得结果。
- 50 种关键基因的突变、CNV 和融合突变类型，例如 EGFR、ALK、BRAF、ROS1、RET、KRAS、PIK3CA 和 ERBB2 等
- 一天的无手动操作工作流程，仅需点击两步和 10 分钟的手动操作时间
- 仅需 10 ng 的 DNA/RNA，可检测更多样本
- 兼容 FFPE 组织和液体活检样本
Oncomine Precision Assay内容
该检测试剂盒具有 50 种基因的极普遍和潜在相关癌症驱动基因突变，包括潜在的重要耐药驱动突变，是临床癌症研究中进行快速基因组分析的理想选择。
低起始量，高成功率
一些 NGS 外送实验室的检测失败率达 20%，因为它们需要较高的起始量。在这个比例下，每五份提交的样本中就有一份因为组织样本不足而无法通过QC，而且还有许多样本根本无法提交进行检测。
Oncomine 解决方案可改变这一状况。
您可通过 Oncomine 检测试剂盒获得超过 95% 的测序成功率，因为我们只需要 10 ng 的核酸起始量。这意味着您可以从自己拥有的绝大部分珍贵样本获得 NGS 结果。
兼容 FFPE 组织和液体活检样本
在分析每份重要癌症样本的诉求中，组织仍然是一个问题，尤其是对于某些癌症类型（例如非小细胞肺癌 [NSCLC]）。Oncomine Precision Assay 可提供 FFPE 组织检测结果和液体活检样本检测结果（如果没有组织），也可用于监测癌症谱开发的后续操作
FusionSync 检测技术
一定数量的已知和频发性融合异构体构成了能检测到的大部分融合。即使在样本输入量少或转录水平较低的逆境下，这些异构体的特定设计对于极大程度提高检测能力非常重要。
Oncomine Precision Assay经过优化和同步设计，可在低转录水平或低输入水平下实现全面、灵敏的融合检测（包括选定驱动基因的新融合）。
- 针对极常见和普遍的融合异构体（例如 EML4 -ALK、ETV6-NTRK3、KIF5B-RET 等），进行靶向的已知融合检测
- 对靶向驱动基因和伙伴基因的新型融合组合进行非靶向检测
- 通过专有的外显子拼接不平衡方法进行新型融合检测
Oncomine Precision Assay性能
对 FFPE 对照品使用 Oncomine Precision Assay 的性能表现
| 样本 | 检测范围 | 变异类型 | 每份样本的 变异数量 | 样本重复 数量 | 灵敏度 | PPV |
| 内部 FFPE 对照品 | 4.8% + 2.3% SD AF* | SNV | 67 | 32 | 99.6% | 99.6% |
| 插入缺失 | 4 | 32 | 100% | 100% | ||
| Horizon 结构多重 FFPE 参考标准品 | 3.5% 至 17% AF* | SNV/插入缺失 | 15 | 32 | 100% | 100% |
| 4.5 拷贝 | CNV | 1 | 32 | 93.8% | 100% | |
| SeraSeq FFPE 肿瘤融合 RNA 参考材料 | 10-258 拷贝 | 融合 | 13 | 32 | 98.6% | 99.3% |
| SeraSeq FFPE NTRK 融合 RNA 参考材料 | 94-377 拷贝 | 融合 | 15 | 32 | 99.2% | 99.2% |
| SeraSeq® 肺部与脑部 CNV 混合物 | + 3 拷贝（5 拷贝） | CNV | 2 | 32 | 100% | 100% |
| SeraSeq® 乳腺 CNV 混合物 | + 3 拷贝（5 拷贝） | CNV | 2 | 32 | 100% | 100% |
注：作为产品验证测试的一环，在多个内部研发实验室进行了检测。在不同的多重水平上运行样本。将使用 Oncomine Precision Assay 和 FFPE 对照品进行额外的验证和校验测试；因此最终的性能值可能不同。
* 表示在 Genus 系统上使用 Oncomine Precision Assay 观察到的等位基因频率。
对液体活检对照品使用 Oncomine Precision Assay的性能表现
| 检测范围 | 变异类型 | 每份样本的 变异数量 | 样本重复 数量 | 灵敏度 | PPV |
| 0.33% + 0.17% SD AF* | SNV | 67 | 32 | 89.2% | 100% |
| 插入缺失 | 4 | 32 | 100% | 100% | |
| 1.16X 倍数变化 | CNV | 1 | 32 | 100% | 100% |
| 总 RNA 中，1% 三融合和 MET 外显子 14 跳跃 | 融合 | 1 | 32 | 97.7% | 96.4% |
注：作为产品验证测试的一环，在多个内部研发实验室进行了检测。在不同的多重水平上运行样本。将使用 Oncomine Precision Assay 和 FFPE 对照品进行额外的验证和校验测试；因此最终的性能值可能不同。
* 表示在 Genexus 系统上使用 Oncomine Precision Assay 观察到的等位基因频率。
更多有关 Oncomine 解决方案在精准肿瘤学中应用的信息，请访问 oncomine.com。
仅供科研使用，不可用于诊断目的。