Search Thermo Fisher Scientific
トランスレーショナルプロテオミクス
大規模プロテオミクス
質量分析に関する技術革新により、トランスレーショナルプロテオミクスに関連する性能が飛躍的に向上しており、健康や疾患に関する理解に影響を及ぼしています。トランスレーショナルプロテオミクスは、他の Omics 領域（ゲノミクス、トランスクリプトミクス、メタボロミクス／リピドミクス）を補完することで、定量性、再現性、標準性、拡張性を備えた臨床的に重要な結果を生成できる新しいワークフローを実現します。
Thermo Scientific Orbitrap LC-MS ワークフローは、探索研究から臨床応用までのプロセスを加速し、各プロセスがうまくいくようにサポートします。
トランスレーショナル研究は、基礎科学知識から、人の健康を改善するための検査、診療、および治療への転換を加速しています。トランスレーショナルプロテオミクスは、臨床的に重要なタンパク質バイオマーカーの探索に用いられることが多く、タンパク質の確実な同定から確認およびバリデーションにできるだけ早急に移行することが重要です。
疾患に関する研究は複雑であるため、研究者や検査室がこれまでにないレベルで協力し、さまざまな Omics 分野を統合する必要があります。弊社は業界をリードする専門家と協力し、その分野における最新かつ最適な方法を提供します。
大規模プロテオミクスのための標準性および再現性を備えたワークフロー
サーモフィッシャーはトランスレーショナルプロテオミクスの研究者にさまざまソリューションを提供する独自のポジションを確立しています。臨床研究分野における再現性と標準性を備えたニつの分析プロテオミクスワークフローを開発しました。
タンデム質量タグ（TMT）ワークフローは大規模なマルチプレックス定量的プロテオミクスの手法で同重体タグまたは標識を用いてハイスループット定量スクリーニングを実施します。プロテオミクスにおいて最高レベルの正確性と再現性を持つ定量ワークフローです。
Click to enlarge
プロテオミクスで得られる知見がゲノミクスの結果を補完します。たとえばがん研究では、プロテオミクスにより体細胞突然変異とがんシグナルを結び付け、機能的影響を解明することができます。プロテオゲノミクスで得られる特徴が、乳がんの移動移植片中の治療ターゲットとして利用できる可能性も示されています。
TMT マルチプレックス定量的プロテオームのワークフローはその高いスループットと詳細な解析で多くのがん研究室から大きな関心を持たれ、採用されています。
このマルチプレックスワークフローでは、正確かつ高精度の定量を可能にする独自の SPS-MS3 性能を搭載した Orbitrap Fusion Lumos トライブリッド MS システムを効果的に活用します。
TMT マルチプレックスワークフロー用製品
プリカーサーレベルの定量はラベルフリー定量の新しいスタンダードです。この方法を用いれば、定量結果の欠測値が減少し、完全な定量が実施できます。このワークフローは大規模なサンプルコホートの分析において再現性と正確性を発揮します。また、プロテオミクスおよび臨床研究で役立つ柔軟性も備えています。
Click to enlarge
プリカーサーレベルの定量には、ニつの方法がよく用いられます。データ依存的分析（DDA+）および高分解能データ非依存的分析（HR-DIA）です。
DDA+ ワークフローは標準ラベルフリー定量（LFQ）の厳密性を保つために最適化された完全なワークフローに、実証済みのデータ依存的分析手法を取り入れています。このワークフローは従来の DDA で起こる「欠測値」の問題をほぼ完全になくすことができます。
HR-DIA は、補完的な LFQ ワークフローであり、LC-MS 分析で検出可能なすべてのペプチドを迅速に同定し、再現性のある定量を実施できるため、大規模研究に適しています。Biognosys 社の Spectronaut ソフトウェアは、スペクトルライブラリの作成や大規模 DIA データセットの処理を行う効率的なパイプラインを提供します。
いずれのプリカーサーレベルのラベルフリー定量ソリューションも、新しい Thermo Scientific 150 um ID EASY-Spray カラムおよび Q Exactive HF-X MS と一緒に使用して感度、耐久性、スループットのバランスをとることにより、キャピラリーフロー Thermo Scientific UltiMate 3000 RSLCnano システムを有効活用できます。
プリカーサーレベルの定量ワークフロー用製品
タンデム質量タグ（TMT）ワークフローは大規模なマルチプレックス定量的プロテオミクスの手法で同重体タグまたは標識を用いてハイスループット定量スクリーニングを実施します。プロテオミクスにおいて最高レベルの正確性と再現性を持つ定量ワークフローです。
Click to enlarge
プロテオミクスで得られる知見がゲノミクスの結果を補完します。たとえばがん研究では、プロテオミクスにより体細胞突然変異とがんシグナルを結び付け、機能的影響を解明することができます。プロテオゲノミクスで得られる特徴が、乳がんの移動移植片中の治療ターゲットとして利用できる可能性も示されています。
TMT マルチプレックス定量的プロテオームのワークフローはその高いスループットと詳細な解析で多くのがん研究室から大きな関心を持たれ、採用されています。
このマルチプレックスワークフローでは、正確かつ高精度の定量を可能にする独自の SPS-MS3 性能を搭載した Orbitrap Fusion Lumos トライブリッド MS システムを効果的に活用します。
TMT マルチプレックスワークフロー用製品
プリカーサーレベルの定量はラベルフリー定量の新しいスタンダードです。この方法を用いれば、定量結果の欠測値が減少し、完全な定量が実施できます。このワークフローは大規模なサンプルコホートの分析において再現性と正確性を発揮します。また、プロテオミクスおよび臨床研究で役立つ柔軟性も備えています。
Click to enlarge
プリカーサーレベルの定量には、ニつの方法がよく用いられます。データ依存的分析（DDA+）および高分解能データ非依存的分析（HR-DIA）です。
DDA+ ワークフローは標準ラベルフリー定量（LFQ）の厳密性を保つために最適化された完全なワークフローに、実証済みのデータ依存的分析手法を取り入れています。このワークフローは従来の DDA で起こる「欠測値」の問題をほぼ完全になくすことができます。
HR-DIA は、補完的な LFQ ワークフローであり、LC-MS 分析で検出可能なすべてのペプチドを迅速に同定し、再現性のある定量を実施できるため、大規模研究に適しています。Biognosys 社の Spectronaut ソフトウェアは、スペクトルライブラリの作成や大規模 DIA データセットの処理を行う効率的なパイプラインを提供します。
いずれのプリカーサーレベルのラベルフリー定量ソリューションも、新しい Thermo Scientific 150 um ID EASY-Spray カラムおよび Q Exactive HF-X MS と一緒に使用して感度、耐久性、スループットのバランスをとることにより、キャピラリーフロー Thermo Scientific UltiMate 3000 RSLCnano システムを有効活用できます。
プリカーサーレベルの定量ワークフロー用製品
動画
サーモフィッシャーサイエンティフィック、プロテオミクスおよびメタボロミクスマーケティング部門の Andreas Huhmer 博士が、安定性、標準性、拡張性を備えた大規模なサンプルコホート分析方法の必要性について解説します。
ニューヨーク州立大学バッファロー校 Pharmaceutical Sciences の Jun Qu 教授が、プリカーサーレベルの定量についておよび高精度かつ高感度の定量結果を得るための欠測値の低減について解説します。