Silencer siRNA 文库是靶向从各类功能基因到全基因组的基因组合的 siRNA 集,因此它们适用于通路分析和靶标鉴定与验证。大部分文库针对每个基因提供三种单独的 siRNA,以提高数据可靠性。文库中提供了完整的 siRNA 序列信息。
新版本:
- Silencer 磷酸酶 siRNA 文库,v3
- Silencer 可成药人类基因组 siRNA 文库,v3
- Silencer 人类基因组 siRNA 文库,v3
标准 siRNA 文库规格为 96 孔板,每孔含 1 或 2 nmol siRNA。留有空列,可以方便地将对照添加至检测板中。但是,Ambion 可轻松地满足定制铺板和等分要求。这种灵活的规格可使研究人员规定每孔中的 siRNA 量、加入对照或其他 siRNA、定制 siRNA 库,甚至可以安排 96 孔板或 384 孔板中的 siRNA 布局。*
对于各 siRNA 所需量较少并需要快速周转时间的研究人员,Ambion 现在提供了受欢迎的激酶、磷酸酶和可成药人类基因组 siRNA 文库,以可直接运输的规格提供,其中各 siRNA 的含量为 0.25 nmol(图 1)。该含量足以在 96 孔板中使用 30 nM 的各 siRNA 完成 > 80 次转染。
图 3. 在 RNAlater 中储存的小鼠组织的 mRNA 谱图。多种小鼠组织在 RNAlater 中于 4°C 下储存 1 或 4 周。从各组织中分离 RNA,并使用
RPA III™ 试剂盒进行分析。将 10 µg 总 RNA 与 5 个混合反义 RNA 探针(每个探针 5 x 104 cpm)杂交,用 RNase 消化并沉淀。在 5% 聚丙烯酰胺/8 M 尿素凝胶上对产物进行评估,并且在 -80°C 下使用增感屏暴露于膜 4 小时。
图 1.更新的 Silencer siRNA 文库。RefSeq 第 15 版中包含的人类基因组 siRNA 文库靶基因第 3 版中的 siRNA。
正在将基因组和转录组信息快速添加到公共数据库中。Ambion 的
Silencer 人类基因组和可成药人类基因组 siRNA 文库的最新版本 (v3) 已根据最近的 NCBI 数据库版本进行了更新。此外,与先前版本相比,这些新版本包括更多经验证的 siRNA,并且可成药基因组 siRNA 文库靶向的基因范围扩大(图 2)。
Silencer siRNA 文库具有预定义和定制的高功能性、特异性 siRNA,能够在您的通路分析或药物发明研究中实现基因靶标的快速、高通量鉴定和验证。
图 3. 在 RNAlater 中储存的小鼠组织的 mRNA 谱图。多种小鼠组织在 RNAlater 中于 4°C 下储存 1 或 4 周。从各组织中分离 RNA,并使用
RPA III™ 试剂盒进行分析。将 10 µg 总 RNA 与 5 个混合反义 RNA 探针(每个探针 5 x 104 cpm)杂交,用 RNase 消化并沉淀。在 5% 聚丙烯酰胺/8 M 尿素凝胶上对产物进行评估,并且在 -80°C 下使用增感屏暴露于膜 4 小时。
图 2.第 3 版
Silencer 可成药人类基因组 siRNA 文库和扩展可成药人类基因组 siRNA 文库。第 3 版 Silencer 可成药人类基因组 siRNA 文库中的 siRNA 靶向 7,784 个基因,这些基因属于饼图和表中描述的功能类别(黑色文本)。为了实现更广泛的覆盖范围,扩展可成药人类基因组 siRNA 文库靶向 9,102 个基因(黑色和绿色文本),包括转录因子和辅因子、细胞连接蛋白、分子伴侣、膜运输蛋白和细胞外基质蛋白。
*文库支持定制,其中各 siRNA 含量 > 1 nmol。