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虽然这种方法非常有效,但无法对基因如何在整个生物体内发挥作用进行关键性评估。为解决这个问题,研究人员目前正在体内应用 RNAi。尽管研究仍处于早期,但在体内使用 RNAi 已显示出前景并取得了重大进展。
调整两种触发 RNAi 的基本方法以在体内使用:递送 siRNA,以及递送表达短发夹 RNA(shRNA;随后加工成活性 siRNA)的质粒和病毒载体。与在培养细胞中应用 RNAi 一样,使用 siRNA 比使用 shRNA 表达载体更常见。对于在培养细胞中进行的 动物RNAi实验,更容易获得靶向特定感兴趣靶标的有效 siRNA,并且由于这些 siRNA 较小且仅需要穿过细胞膜而不需要穿过核膜发挥作用,所以更容易递送。相比之下,构建 shRNA 表达载体比较耗时,特别是当考虑到创建和测试多个 shRNA 序列以找到有效序列所需的时间时。siRNA 也比基于质粒的 shRNA 表达载体更容易递送,并且也不会像逆转录病毒(包括慢病毒)和腺病毒载体分别会出现插入诱变和免疫原性方面的相关问题。
siRNA 在体内成功介导基因沉默取决于 siRNA 在感兴趣特定组织的脉管系统中的有效递送和保留,以及在这些细胞中的有效摄取。此外,siRNA 必须保持稳定,直到能够到达其最终位置。虽然时间较早,但曾有关于局部和全身递送 siRNA 的成功报告。
获得的最大成功也许是在眼部进行 siRNA 局部给药。经证实在小鼠视网膜下腔注射靶向 VEGF 的 siRNA 可减少眼部血管新生 [1]。在该模型中,无需像在某些其他系统中需要对 siRNA 进行修饰或将 siRNA 与脂质聚合物或其他递送试剂复合。最近,由 Acuity Pharmaceuticals 开发并设计通过玻璃体内注射递送的靶向 VEGF 的 siRNA 进入了 II 期临床试验,用于治疗湿性年龄相关性黄斑变性。
在大鼠模型中,已使用外科植入泵通过鞘内输注成功将疼痛相关阳离子通道 P2X3 的经修饰 siRNA递送至大鼠脑中;在该模型系统中,siRNA 显著抑制了神经病理性疼痛反应 [2]。虽然这种方法对于许多研究人员来说并不实用,但其证明可以成功将 siRNA 局部递送至啮齿类动物的脑中,并且使用 siRNA 进行 CNS 相关基因的体内功能基因组学研究是可能的。
在研究肺部疾病和传染性疾病,以及可能治疗流感、SARS 和由 RNA 病毒引起的其他临床相关肺病的尝试中,研究人员对将 siRNA递送至肺部有相当大的兴趣。在一项有前景的研究中,在灵长类动物中使用鼻内递送系统递送 SARS 病毒特异性 siRNA,使得发热减少、病毒载量降低和肺泡损伤降低 [3]。该研究证实了 siRNA 经鼻内递送至肺部的有效性。
首次在小鼠中使用流体动力学尾静脉注射†证明了在哺乳动物中进行全身体内 siRNA递送的可行性。在该程序中,将未修饰的 siRNA 溶于大量水溶液中并快速注射至尾静脉,最终定位至肝细胞内 [3]。尽管该程序不具有临床相关性,但能够在啮齿动物肝脏内进行基因功能和药物靶标验证研究,直至开发出更有效的递送技术。为支持该技术,Song 及其同事发现流体动力学注射 Fas siRNA 导致小鼠肝细胞中的 Fas 沉默持续 10 天。这种处理可保护肝细胞免受 Fas 抗体和伴刀豆球蛋白 A 刺激导致的细胞凋亡,并保护小鼠不发生暴发性肝炎 [4]。同样,流体动力学尾静脉注射半胱天冬酶 8 siRNA 可保护小鼠不发生 Fas 抗体或 Fas 配基表达诱导的急性肝功能衰竭 [5]。
最近,在小鼠中以小体积、正常压力通过静脉递送靶向载脂蛋白 B 的经修饰 siRNA 导致肝脏和空肠发生了基因沉默。siRNA 可与胆固醇结合以进行靶向递送,并包括骨架和糖修饰以增强血清稳定性 [6]。
可能需要全身递送 siRNA 以靶向大多数肿瘤类型以及许多其他体内靶标。为此,几个小组正在研究使用基于脂质和基于纳米颗粒的 siRNA递送复合物 [7-10]。
全身递送 siRNA 的研究阐明了在体内成功递送 siRNA 必须克服的三个障碍:选择性递送至预期组织中、在前往靶组织的途中提供充分保护以防降解以及避免 siRNA 被快速排泄。令人惊讶的是,经证实快速排泄是比体内稳定性更重要的问题 [11]。尽管通过 siRNA 修饰可以很容易实现化学稳定性,但在大多数情况下显然是没有必要的,因为 siRNA 在降解之前就已经被排泄。目前使用纳米颗粒或脂质复合物在解决体内 siRNA递送特有的药代动力学和组织分布问题方面比化学修饰更有前景。
为支持越来越多地在体内使用 siRNA 的情况,Ambion 现在提供了一种新等级的 siRNA,称为 Silencer In Vivo Ready siRNA,专门用于动物研究。这些 siRNA 具有以下特点: